空调消毒剂利用的是对微生物有杀灭或抑制作用的化学药剂。抑制或杀灭微生物的化学药物很多，其杀菌作用的强弱随其本身的毒性、浓度、进入细胞的渗透性及微生物的种类的不同而有差异，一般来说，在极低浓度时，会对微生物有刺激生长的作用，随着浓度逐渐增高，就会相继出现抑菌、消毒、灭菌作用的一个连续作用谱。
空调消毒剂对微生物有杀灭或抑制作用的化学药品可分为消毒剂和治疗剂。消毒剂因对人体组织细胞有损害作用，只能外用，常规浓度下的化学治疗剂对人体组织细胞的损害较小，既可外用也可内用。化学消毒剂常以液态或气态的形式使用，液态消毒剂一般是通过喷雾、浸泡、洗刷、涂抹等方法使用，气态消毒剂通常是以加热、氧化、焚烧等方法进行。
过氧乙酸具有强氧化作用，可迅速杀灭各种微生物，包括病毒、细菌、真菌及芽胞，空调消毒剂是一种高效、广谱、速效杀菌剂。其分解产物是醋酸、过氧化氢、水和氧气，因此使用后不会留下任何有害物质，可广泛用于各种器具、空气环境消毒。但原液为强氧剂，具有较强的腐蚀性，不可直接用手接触。
